يستخدم الإينوكسابارين لمنع تجلط الأوردة العميقة والانسداد الرئوي. علاج تجلط الدم الوريدي الموجود. منع تكوين خثرة في الدورة الدموية خارج الجسم أثناء غسيل الكلى. علاج الذبحة الصدرية غير المستقرة واحتشاء عضلة القلب بدون موجة Q. ويستخدم ملح الصوديوم إنوكسابارين الصوديوم سريرياً.